2015年安徽省教育厅批准安庆师范大学建立水生生物保护与水生态修复安徽省高等学校工程技术研究中心（皖教秘科[2015]34号），是我国长江江豚保护联盟单位，安徽省水生态修复与水生动物保护技术支撑单位。目前工程中心固定研究成员7人，在读研究生12人，高级职称7人，具博士学历6人，平均年龄40岁。近5年来，获国家自然基金3项、省自然基金1项，省重大专项2项等纵向课题14项，计247万元。获横向课题60项，经费2187万元；获省科学技术进步三等奖。获专利22项，其中发明专利7项；发表论文41篇，SCI收录期刊26篇，EI收录3篇，CSCD12篇。其研究方向主要为：

  1、水生生物保护研究：通过河流生物群落结构的时空动态、多样性与稳定性研究，揭示顶级大型水生动物（如豚类）的灭绝机制，提出相应的保护措施；目前致力于中国长江江豚和柬埔寨湄公河伊河海豚保护研究，以及我国特色、稀有的长麦穗鱼生态策略研究。

  2、水生生态修复技术研究：对受损湖泊生态系统结构和功能完整性进行研究，解析鱼类、底栖动物和湿地植物等代表类群对水文、水质和底质等条件的需求阈值，研发基于水文-生物-基质等复合条件的一体化生态修复技术。

  3、水生毒理及疾病防控：基于水生生物生活史和污染物的分布特点，研究水位波动、洪水脉冲等水文因素作用下洪泛区水生生物及污染物的扩散机制。利用基因组学、生物信息学、分子免疫学等先进研究方法和技术和现代医学防治概念，从病原、宿主以及病原和宿主间的相互作用入手，从分子水平探讨鲫鱼、长江江豚等水生动物主要细菌性疫病爆发的机制，全面提升水生动物疫病防控水平。